Научно-исследовательский и производственный центр «Экотехцентр» был создан в 1996 году, после реорганизации Волжского научно-исследовательского института гидротехники и мелиорации «ВолжНИИГиМ» и упразднения специализированного подразделения по комплексному решению проблемы рыбозащиты на водозаборах НПЦ «Рыбозащита».
В «Экотехцентре» нашли свое место работы и составили основной костяк предприятия ведущие специалисты ликвидированного подразделения «ВолжНИИГиМ». Поэтому НИПЦ «Экотехцентр» сохранил основное направление деятельности расформированного НПЦ «Рыбозащита» — разработка и осуществлениe рыбозащитных мероприятий на водозаборах.
Сейчас штат «Экотехцентра» состоит из высококвалифицированных специалистов-экспетров — гидротехников, инженеров, физиков, биологов, — которые уже более 30 лет осуществляют внедрение высокоэффективных средств защиты рыб от негативного антропогенного воздействия. Благодаря им, предприятие осуществляет активную научно-исследовательскую деятельность и проектирование гидротехнических сооружений.
С момента образования предприятие постоянно находится в развитии: повышается квалификация специалистов, расширяется объем и виды деятельности, приобретается новое современное оборудование, расширяется география и опыт проведения работ.